La bande de Scooby se dirige vers l'inquiétante ville de Banning Junction pour passer Halloween avec la tante de Velma (voix de JULIA SWEENEY), son oncle (voix de DIEDRICH BADER) et sa ravissante et séductrice cousine Marcy (voix de JENNY McCARTHY). La bande se joint aux habitants de la ville pour célébrer les fameux « 100 ans d'Halloween » qui incluent le couronnement de la reine du bal masqué et un concert de KISS (avec la voix de PAUL STANLEY). Mais lorsque les problèmes surgissent, une villageoise effrayée (voix de RHEA PERLMAN) accuse le fantôme de Hank Banning, le fondateur de la ville et maire forcé de démissionner, qui vient pour se venger dans la ville qui lui avait fait ddu tort 100 ans plus tôt. Pendant que Shaggy et Scooby attendent nerveusement de rencontrer KISS avant la collecte des bonbons d'Halloween, ils aident à contrecœur Fred, Daphne, et Velma à découvrir qui se cache derrière cette mascarade d'Halloween.

La bande assiste à un festival de la renaissance où un dragon interrompt la fête !

La bande Mystery Inc. voyage en Egypte où dans des fouilles une momie en liberté transforme tout le monde en zombies.

Shaggy est victime d'un sort qui le transforme chaque nuit lorsqu'il est endormi en un monstre géant.

Pendant qu'ils rendent visite aux filles ensorcelées dans un château de Transylvanie, lande tombe nez à nez avec un vampire bien vivant.

Les chiots Secret Six sont enlevés lors d'une exposition canine, et c'est à Scooby et à la bande de les sauver.

Pendant qu'ils assistent aux Grind Games, la bande tombe par hasard sur le fantôme d'un prisonnier Alcatraz qui vise les membres du concours.

Shaggy gagne une visite de l'usine des Scooby Snacks, et la bande doit se battre contre un monstre qui traîne dans l'usine des Scooby Snacks.

Scooby-Doo et la bande accompagnent un pengouin chez lui en Antarctique et trouvent une créature élégante qui inflige à ses victimes un sort glacial.

La bande voyage au Nouveau Mexique et trouve une ancienne et géante créature de mer qui entraîne ses victimes dans son repaire mystérieux.